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エラー内容(というかStackTrace)は以下のリンク先のものと同じ様です。

http://unix.stackexchange.com/questions/94497/org-eclipse-swt-swterror-no-more-handles-gtk-init-check-failed-while-runnin

上記リンクの質問では最終的にはPutty+Xmingな環境つくって解決したように見えますが、
今回はUbuntuのデスクトップ上で実行されているのだと思いますのでその必要はないと思っています。

とりあえずgtkのインストールまたはアップデートを行ってみてはどうでしょう。

エラー内容(というかStackTrace)は以下のリンク先のものと同じ様です。

http://unix.stackexchange.com/questions/94497/org-eclipse-swt-swterror-no-more-handles-gtk-init-check-failed-while-runnin

上記リンクの質問では最終的にはPutty+Xmingな環境つくって解決したように見えますが、
今回はUbuntuのデスクトップ上で実行されているのだと思いますのでその必要はないと思っています。

とりあえずgtkのインストールまたはアップデートを行ってみてはどうでしょう。