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効果があるかどうか判りませんが、ionice を使ってみてはどうでしょうか?

ionice -n7 $COMMAND

root なら・・・

ionice -c3 $COMMAND
効果があるかどうか判りませんが、ionice を使ってみてはどうでしょうか?

    ionice -n7 $COMMAND

root なら・・・

    ionice -c3 $COMMAND