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システム設計の観点から言語を選択する際に、実際のシステムの要求や予算、などから決めないといけません。
Javaの場合は開発環境やサーバーOS、などの調達はほとんど無償で入手できます。
開発で使用される書く製品のサポートはバラバラになっています。

DotNet(C#、VB.net)などで開発する場合、開発環境などの調達のにコストがかかります。
MSDNは開発のに必要な物は揃っている。製品の統一性はあります。

何を選択するかは要求次第だと思います。

システム設計の観点から言語を選択する際に、実際のシステムの要求や予算、などから決めないといけません。
Javaの場合は開発環境やサーバーOS、などの調達はほとんど無償で入手できます。
開発で使用される書く製品のサポートはバラバラになっています。

DotNet(C#、VB.net)などで開発する場合、開発環境などの調達のにコストがかかります。
MSDNは開発のに必要な物は揃っている。製品の統一性はあります。

何を選択するかは要求次第だと思います。